崇明县水文站与上海市水环境监测中心崇明分中心，两块牌子一套班子，同位于新崇北路1号，成立于1979年，隶属于县水务局，业务上受上海市水文总站指导，现有在职职工32人，下设有办公室、水文测验设备科、水环境监测科、堡镇水位站、崇西水文站、永隆沙水位站、新建雨量站、南门雨量站和堡镇北闸雨量站。主要工作职责是对全岛域范围内的水文资料（潮水位、降水量、蒸发量、水温、气压、风向风速、氯化物等）进行测验、收集、整理和预报，对岛内水环境和水厂取水口进行全面调查、监测和评价工作。持有水文、水资源调查评价乙级证书，水环境监测中心于九六年通过国家认证部门的计量认证。同时还对外承接各项水文测验、河道测量、水下地形勘测、水环境监测以及水文水质评价咨询等工作，享有良好信誉。